No Rio Grande do Norte, Fernando Freire tem quatro condenações. Uma em 2012, de 84 anos de prisão, por desvios de recursos públicos e outros crimes. Esta sentença foi acrescida de 6 anos em decisão tomada em 2014.

E outro processo, Fernando Freire e várias outras pessoas, foi condenado a 19 anos e 11 meses de prisão por ter feito parte da “Máfia dos Combustíveis”. Esta sentença foi assinada no dia 12 de dezembro de 2014.

Outra sentença contra Fernando Freire e seus aliados “políticos” foi assinada pela Justiça do Rio Grande do Norte no dia 12 de novembro de 2014. Nesta, ele foi condenado a 10 anos de prisão.

Neste último caso, Fernando Freire foi processado pelo Ministério Público Estadual por desvios de recursos públicos através de concessões de diárias a servidores que depois os repassava para ele.